Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FNDC9Q8TBE3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms