Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD1Q8NHV4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms