Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms