Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms