Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
HECW1Q76N89 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms