Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms