Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSH2Q76I76 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms