Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMUB2Q71RG4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms