Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL17Q6UXB2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL17Q6UXB2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms