Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms