Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms