Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf140Q5VVS0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf140Q5VVS0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf140Q5VVS0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf140Q5VVS0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms