Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms