Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms