Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms