Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
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