Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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