Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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