Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLFQ16534 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLFQ16534 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLFQ16534 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms