Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SSX1Q16384 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SSX1Q16384 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SSX1Q16384 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SSX1Q16384 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SSX1Q16384 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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