Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZFHX3Q15911 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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