Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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VAMP3Q15836 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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VAMP3Q15836 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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VAMP3Q15836 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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VAMP3Q15836 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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VAMP3Q15836 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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VAMP3Q15836 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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VAMP3Q15836 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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VAMP3Q15836 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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