Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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