Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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