Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms