Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms