Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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COL19A1Q14993 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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COL19A1Q14993 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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COL19A1Q14993 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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COL19A1Q14993 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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