Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms