Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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COL4A6Q14031 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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COL4A6Q14031 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms