Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGB1Q14028 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGB1Q14028 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
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