Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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