Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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