Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms