Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K1Q13233 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms