Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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