Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMAN2Q12907 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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