Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
STX4Q12846 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
STX4Q12846 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
STX4Q12846 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
STX4Q12846 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
STX4Q12846 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
STX4Q12846 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
STX4Q12846 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
STX4Q12846 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
STX4Q12846 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
STX4Q12846 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
STX4Q12846 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
STX4Q12846 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
STX4Q12846 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
STX4Q12846 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
STX4Q12846 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
STX4Q12846 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
STX4Q12846 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
STX4Q12846 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
STX4Q12846 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
STX4Q12846 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
STX4Q12846 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
STX4Q12846 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
STX4Q12846 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
STX4Q12846 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
STX4Q12846 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms