Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms