Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC15Q0P6D6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms