Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms