Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EP300Q09472 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EP300Q09472 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EP300Q09472 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EP300Q09472 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EP300Q09472 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EP300Q09472 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EP300Q09472 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EP300Q09472 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EP300Q09472 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EP300Q09472 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EP300Q09472 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EP300Q09472 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EP300Q09472 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EP300Q09472 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EP300Q09472 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EP300Q09472 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EP300Q09472 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EP300Q09472 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EP300Q09472 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EP300Q09472 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EP300Q09472 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EP300Q09472 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EP300Q09472 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EP300Q09472 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EP300Q09472 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EP300Q09472 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EP300Q09472 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EP300Q09472 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EP300Q09472 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EP300Q09472 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EP300Q09472 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EP300Q09472 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EP300Q09472 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EP300Q09472 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EP300Q09472 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EP300Q09472 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EP300Q09472 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EP300Q09472 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EP300Q09472 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EP300Q09472 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EP300Q09472 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EP300Q09472 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EP300Q09472 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EP300Q09472 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EP300Q09472 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EP300Q09472 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EP300Q09472 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EP300Q09472 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EP300Q09472 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EP300Q09472 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EP300Q09472 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EP300Q09472 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EP300Q09472 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EP300Q09472 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EP300Q09472 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EP300Q09472 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EP300Q09472 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
EP300Q09472 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EP300Q09472 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EP300Q09472 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EP300Q09472 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EP300Q09472 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EP300Q09472 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms