Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSRP1Q08945 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.3 ms