Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms