Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF4Q08170 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms