Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms