Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms