Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms