Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBE1Q04446 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms