Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms