Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRG1Q02297 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms